巴塞隆納
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伊涅斯塔出身於加泰隆尼亞俱樂部巴塞隆納，於2002年10月被當時教練范加爾挑中，首次代表巴塞隆納一隊出場，在歐聯中作客對比利時的布魯日。在荷蘭人法蘭克·里杰卡爾德出任主教練後，他上場時間持續增加，水平也大有提高。2005-2006賽季，由於球隊在國內聯賽和歐冠兩線作戰以及巴塞隆納不斷有中場球員受傷，得到了更多的首發機會。尤其是歐冠中，挑戰義大利俱樂部AC米蘭的兩場比賽擔任防守中場，凍結了對方中場安德烈亞·皮爾洛的進攻組織，並在當月入選當月歐洲最佳陣容。在對陣英格蘭球隊阿森納決賽中，下半場替補出場，被譽為改變了比賽結果的關鍵人物之一。
2009年開始，在當時的總教練瓜迪奧拉帶領下，巴塞隆納在國內外的賽事中橫掃，其中在09年實現「六冠王」及2011年實現「五冠王」的賽季中，伊涅斯塔是重要功臣之一。2009年的歐聯四強，對切爾西在最後時刻，攻入關鍵扳平球，成功帶領球隊進入決賽。他與哈維搭擋中路更被譽為是當代最穩健、最令歐洲列強恐懼的一條中場線，被外界評為只要他們兩個在場上，就可以產生1+1=3的化學反應。
2018年4月27日，伊涅斯塔宣佈今季西甲賽季結束後，將會完約離開巴塞隆納，結束22年巴塞隆納球員生涯。
神戶勝利船
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伊涅斯塔本來首選是去中國(重慶)掏金，但受限於重慶對於球隊撒天價引進外援的能力有限(加上中超開始限制外援薪金)，未能達成共識的情況下於2018年5月加入日本日職聯的神戶勝利船，簽約三年、年薪2500萬歐元，成為當時全球第4高薪的足球員。
2020年1月1日，伊涅斯塔以隊長身份捧起日本天皇盃的獎盃。
2021年5月11日，伊涅斯塔與神戶勝利船簽署了一份續約合同，讓他在俱樂部再留多兩個賽季[3]。
2023年5月, 伊涅斯塔召開記者會, 宣佈與神戶勝利船於7月1日提前結束合同並出席最後一場日職比賽,但仍未決定是否退役 。
轉戰阿聯
2023年8月9日，酋長FC官方正式宣布伊涅斯塔加盟球隊，雙方將簽約一年至2024年6月，並包含續約一年的選項。
2024年10月7日，伊涅斯塔宣佈正式退役[4]。